Le séquençage des génomes du coronavirus est un outil essentiel pour surveiller l'épidémie de Covid-19 et les mutations du coronavirus.
). Mais cette fois, la France est prête, à en croire le gouvernement. Le 22 avril, le ministre de la Santé Olivier Véran affirmait que “44.000 séquençages [de génomes du coronavirus, NDLR] ont été réalisés depuis février, 5000 la dernière semaine”. Ce qui placerait la France au “troisième rang européen”.
Pendant ce temps, la France séquence peu, très peu. “On était en retard en 2020 et nous avions sous-estimé la capacité à muter du coronavirus”, concède Bruno Coignard, directeur des maladies infectieuses à Santé publique France . “Début janvier, nous avons donc mis en place un consortium, EMER-GEN, pour accroître les capacités de séquençage françaises”.
“Certes, 44.000 génomes ont été séquencés depuis février, mais seule une partie de ces séquences est partagée à ce jour, avec des délais variables”, explique Florence Débarre. “Sur Gisaid, la base de données mondiale de référence, sur la même période, la France n’a partagé que 18.000 génomes, soit 42% de ce qui a été séquencé”.
Le directeur des maladies infectieuses à SPF concède tout de même que tous les laboratoires ne jouent pas le jeu, sans citer de nom. “On est en train de travailler avec le ministère pour savoir où cela bloque, mais je ne pense pas que ce soit de la mauvaise volonté, plutôt une question de ressource et de technicité”, tempère-t-il.
Il faut bien comprendre que les enjeux sont importants. Suivre en détail les mutations du coronavirus en France permet évidemment de vérifier l’importation de versions dangereuses circulant à l’étranger ou encore de repérer l’apparition de variants totalement nouveaux sur le territoire. Mais elle permet en réalité bien plus.
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